名大スパコン FX100 で作業することが多いが，作業に必要なツールがデフォルトでは入っていないので自分でpythonをインストールすることから始めた．
普通にpythonをインストールすると，後々numpyをインストールしようとしたときにhashlibがないことが問題になるようなので，解決する必要がある．
OSに入っているopensslに問題があるらしいので，opensslを取ってきてインストールしようとすると， OSに入っているperlに問題があるらしいので，perl-5.22.2を取ってきてインストール．
ただし，以下のインストールはログインノードでのpythonおよびnumpyの使用を仮定している． 計算ノードでの実行を考える場合には，マシンが異なるので，別途コンパイルしなければならない． おそらく，これよりもより多くの問題があるだろうし，ネット情報が少ないだろうから大変になると予想される．
Install perl-5.22.2
どうもopensslのインストールにperlのバージョンの問題があるらしかったから，最新版perlをインストール．
$ ./Configure -des -Dprefix=$HOME/local
$ make -j8 2>&1 | tee log.make
$ make installInstall openssl
OpenSSL Homepage からソースパッケージをダウンロードしてきて，展開し，以下のようにしてコンパイルおよびインストールする．
$ ./config shared --openssldir=$HOME/local/openssl --prefix=$HOME/local/openssl
$ make depend
$ make -j12 2>&1 | tee log.make
$ make install最新のバージョンだと何故かconfigureの結果がだいぶ異なっているらしく，configure後に
make depend を要求されない．
しかし，最新バージョンでは後々のpythonコンパイルでいろいろとエラーが出てコンパイルできないので，
openssl-1.0.1t.tar.gz をインストールした．
Install python-2.7.11
上のopensslのインストールが成功すれば，下記のようにしてインストールできる．
$ LDFLAGS="-L$HOME/local/openssl/lib" CFLAGS="-I$HOME/local/openssl/include" ./configure --prefix=$HOME/local
$ export LD_LIBRARY_PATH=$HOME/local/openssl/lib:$LD_LIBRARY_PATH
$ make -j12 2>&1 | tee log.make
$ make installmakeの前に， LD_LIBRARY_PATH
にopensslの共有ライブラリの場所を指定しておかないと， _hashlib と
_ssl のビルドに失敗する． この際， LD_LIBRARY_PATH
の先頭にopensslの共有ライブラリの場所がないといけないのかしらないが，makeの直前に直接exportしないと
libssl.so.1.0.0 や libcrypto.so.1.0.0 などのリンクに失敗するようだ．
Install numpy-1.8.1
$ python setup.py build --fcompiler=gfortran
$ python setup.py installとすることでインストールされる． 以下のようにして確認すべし．
$ python -c "import numpy; print numpy.__version__"Install scipy-0.60.0
こちらはnumpyとは異なり， libblas や liblapack
が存在しないとインストールできないっぽい．
BLASやLAPACKはどこかの説明を読んでインストールする． ~/local/lib/
内にそれらがインストールされたとしたら，そこへのPATHを LD_LIBRARY_PATH
に追加しておく．
$ python setup.py build --fcompiler=gfortran
$ python setup.py install以下のようにして確認すべし．
$ python -c "import scipy; print scipy.__version__"Install docopt
$ cp docopt ~/local/lib/python-2.7/site-packages/Install ase
パッケージをダウンロードしてきて，FX100にコピーし，そのディレクトリへのパスを以下のように，
~/.bashrc.local にいくつか設定すれば良い．
export PYTHONPATH=${PYTHONPATH}:~/src/ase
export PATH=${PATH}:~/src/ase/tools
export LAMMPS_COMMAND=/usr/local/bin/lammps
export VASP_PP_PATH=~/local/vasp/