Mac OSXのバージョンがEl Capitanになってから，Illustrator CS4の調子がすこぶる悪く，ほぼ使えない状態なので，gnuplotなどで出力したグラフを編集してEPSやPDFにする作業が滞っていたので対策を記載．
流れとしては，
- gnuplotから SVG 出力．
- inkscapeで編集．
- inkscapeでEPSもしくはPDF出力．
具体的に必要なのは，gnuplotとinkscapeがインストールされていること．inkscapeはbrewなどでインストールできると思う．
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gnuplotで， :
... gnuplot> set term svg gnuplot> set output 'hoge.svg' gnuplot> replotとして SVG 形式にして出力．
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inkscapeで編集．
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キャンバスサイズの調節．
- すべてを選択しておく．
- キャンバスサイズの変更のため，
File>Document properties...を開く． - 開いたウィンドウの真ん中あたりの，Custum sizeのところで，Unitsを px にし，すべての辺のマージンを 10.0 とする．
Resize page to drawing or selectionボタンを押してキャンバスサイズを調節．
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File>Save as ...でフォーマット（EPSかPDF）を指定して保存．
これでIllustratorがなくても仕事に支障はきたさない．